Investigación Reproducible con Quarto

XII Congreso Colombiano de Botánica
Popayán, Colombia
Noviembre 4 al 8 del 2024

Información general

Fecha: 3 de noviembre del 2024

Horario: 09:00 - 13:00 y 14:00 - 18:00

Lugar: Salón 219 de posgrado, Facultad de Ciencias Naturales, Exactas y de la Educación, Universidad del Cauca, Popayán, Colombia

Cupos: 20

Inversión: desde $50.000 COP (ver detalles)

Inscripción: en la página del XII Congreso Colombiano de Botánica

Contacto: alex.espinosa@udea.edu.co

Descripción

En el mundo académico y científico actual hay una creciente necesidad de transparencia, replicabilidad y accesibilidad en la investigación científica. Siendo la reproducibilidad de la investigación un pilar fundamental para garantizar dichas necesidades, así como para proporcionar validez y confiabilidad en los hallazgos científicos. Con el auge de la ciencia de datos y la creciente complejidad de las investigaciones, es esencial que los investigadores estén equipados con las habilidades y herramientas necesarias para llevar a cabo investigaciones reproducibles.

Quarto, un sistema de escritura y publicación técnica y académica de código abierto, proporciona una plataforma robusta y flexible para este propósito, aprovechando todo el potencial de un entorno de creación unificado (computational notebook) donde se puede integrar diferentes lenguajes de programación, su resultado y texto, produciendo documentos reproducibles en diferentes de formatos de salida.

Este curso, por lo tanto, tiene como objetivo proporcionar a los estudiantes con los conocimientos y habilidades necesarios para realizar investigaciones reproducibles, promoviendo al mismo tiempo los principios de la ciencia abierta. Al hacerlo, los estudiantes no solo mejorarán la calidad de su investigación, sino que también contribuirán a la resolución de problemas del mundo real, generando procesos integrales y transparentes en la comunidad científica en general.

Objetivos

Conocer y entender la importancia y utilidad de realizar investigaciones científicas reproducibles.
Conocer y familiarizarse con las principales características de Quarto que permiten realizar investigaciones reproducibles.
Aprender buenas prácticas que aumentan o mejoran la reproducibilidad de una investigación.

Metodología

El curso se estructura en un formato teórico-práctico, adoptando un enfoque de aprender haciendo para familiarizar a los estudiantes con los conceptos y habilidades necesarios para llevar a cabo una investigación científica reproducible utilizando Quarto, un sistema de escritura y publicación técnica y académica de código abierto.

En la parte teórica del curso, se explorarán los principios fundamentales de la ciencia abierta y reproducible, así como las directrices sobre el uso y manejo de Quarto para la elaboración y publicación de investigaciones reproducibles. En la parte práctica del curso, los estudiantes tendrán la oportunidad de aplicar estos conceptos y habilidades a través de ejercicios prácticos utilizando Quarto, con el objetivo de elaborar documentos reproducibles y aptos para publicación.

A lo largo del curso, se promoverá una participación activa de los estudiantes, fomentando el intercambio de ideas y la colaboración entre ellos. Al finalizar el curso, los estudiantes deberán ser capaces de reconocer la importancia y utilidad de realizar investigaciones abiertas y reproducibles, y estarán equipados con las habilidades necesarias para llevar a cabo dichas investigaciones utilizando Quarto.

Requisitos

Debido a las restricciones impuestas por la universidad organizadora, se requiere que cada participante disponga de su propio ordenador personal. En este equipo, deberá estar instalado el software necesario para el desarrollo del curso. Las instrucciones pertinentes se enviarán varios días antes de la fecha programada.
No se requieren conocimientos previos en Quarto o sistemas similares.

Inversión

Tipo de participante	Valor (COP)
Estudiante asociado ACB 2024	$50.000
Estudiante no asociado ACB 2024	$75.000
Profesional asociado ACB 2024	$75.000
Profesional no asociado ACB 2024	$100.000

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Instructor

Álex Espinosa Correa es Biólogo y candidato a Doctor en Biología de la Universidad de Antioquia UdeA, especializado en el campo de la botánica, la palinología y la aerobiología. Apasionado de la Ciencia Abierta y Reproducible, R, Quarto, la visualización de datos, los SIG, y el software libre y de código abierto (FLOSS).